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Title: Human 1M-duo beadchip

Brand:Illumina

Model: Human 1M-duo beadchip

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Introduction: 芯片信息:Human 1M-duo芯片中包含了超过一百万个探针信息,可以在一张芯片上平行进行2个样本的检测。该款芯片包含针对基因SNPs,标签SNPs,拷贝数变化 (CNV),及其他高价值的基因组区域设计探针,同时还增加了一些新的位点,如:增加了疾病相关的SNP位点,灵活的选择一些基因组编码区高密度的SNP 位点。标签Tag SNPs:根据HapMap挑选标签SNP,在r2 > 0.8 前提下,Caucasian(CEU),Han Chinese/Japanese (CHB/JPT)和Yoruba (YRI)人种中基因组覆盖率分别为96%,95%和86%。提供了最高限度的基因组覆盖率,在基因组中平均间隔为2.4kb。CNV区域:探针覆盖了CNV高发区域如片段复制区域,megasatellites,SNP沙漠,MHC区;覆盖Database of Genomic Variants(DGV)数据库中已报导的CNV区域;特有探针覆盖DGV数据库中尚未报导的CNV区域。ADME(Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion)基因:20,000多个SNPs覆盖300多个与药物代谢相关的基因组区域。MHC区域:包含10,415个SNP标记和483个indel 标记。性染色体:45,591个 X 染色体位点, 4,637个Y染色体位点, 979个伪常染色体区(PAR)SNP位点。线粒体 SNP:138mtSNP。 

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