454 GX System |
454 GS测序系统的优点
GS FLX 高通量测序技术优点
GS FLX系统的测序原理是基于焦磷酸测序法,依靠生物发光对DNA序列进行检测。在DNA聚合酶,ATP硫酸化酶,荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下,GS FLX系统将引物上每一个dNTP的聚合与一次荧光信号释放偶联起来。通过检测荧光信号释放的有无和强度,就可以达到实时测定DNA序列的目的。此技术不需要荧光标记的引物或核酸探针,也不需要进行电泳;具有分析结果快速、准确、高灵敏度和高自动化的特点。
服务内容
数据分析
|
||
操作流程 GS FLX系统减少了传统测序样品制备过程中对大型自动站的依赖,完全不需要进行繁琐的建库过程,也不必进行克隆挑取、微孔板处理等工作,而是利用创新的磁珠和emPCR技术进行样品制备,同时提供完整的后续生物信息学分析解决方案。 1. 样品种类:GS FLX系统支持各种不同来源的样品序列测定,包括基因组DNA,PCR产物,BACs,cDNA及小分子RNA等,不同类型的样品测序都可在一台仪器上完成。 2. 样品DNA打断:样品如基因组DNA或BAC等被打断成300到800bp的片段;对于小分子的非编码RNA,这一步骤并不需要。短的PCR产物则可利用GS融合引物扩增后直接进行步骤4。 3. 加接头:借助一系列标准的分子生物学技术,将3′端和5′端有特异性的A和B接头连接到DNA片段上。接头也将在后继的纯化,扩增和测序步骤中用到。图中仅仅显示了后续步骤中要用到的单链的DNA片段。 4. 一条DNA片段=一个磁珠:接头使成百上千条DNA片段分别结合到一个磁珠上,磁珠被单个油水混合小滴包被后,在这个小滴里进行独立的扩增,而没有其他的竞争性或者污染性序列的影响,从而实现了所有DNA片段进行平行扩增(emPCR)。 5. 一个磁珠=一条读长:经过emPCR扩增后,每个磁珠上的DNA片段拥有了成千上万个相同的拷贝。经过富集以后,这些片段仍然和磁珠结合在一起,随后就可以放入到Pico Titer Plate板中供后继测序使用了。 . 数据读取和分析工具:GS FLX 系统提供三种不同的生物信息学工具对测序数据进行分析,适用于不同的应用。例如多达3Gb序列的重测序,对比已知参考序列进行的扩增产物差异分析及120Mb的从头测序工作等。 |
||