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Data Analysis  

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SNP芯片数据分析

1, 芯片原始数据的处理和基因分型,有统计意义的SNP列表, 描述性统计,如minor allele frequency,Hardy-Weinberg equilibrium等。
显著性检验,实验组与对照组的差异,假阳性率(FDR)的计算等, SNP的关联分析,建立线性模型或logistic回归模型等。(所有的统计可以选择由SAS,SPSS,或S-Plus/R给出)。

2,CNV计算分析。

3,SNP相关基因的功能注释。

4,SNP数据与其他高通量数据整合。

表达谱基因芯片数据分析

1,统计分析。

2,差异基因筛选。

3,功能分类。

4,聚类分析。

5,通路分析。

 

甲基化芯片、外显子芯片等数据分析

 

 

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