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名称:表达谱测序, Illumina Solexa HiSeq2000

品牌:Illumina 型号:表达谱测序|转录组测序

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简介:表达谱测序, Illumina Solexa HiSeq2000, Genome AnalyzerIIx, ABI SOLID4, Roche 454

基因组De novo测序

llumina Genome AnalyzerⅡx系统作为当今世界上最先进、最经济的平台既可进行整个基
因组序列测定也可进行基因组上一个大片断候选区域的序列测定。Solexa的芯片杂交技术与可逆中止化合物染料(reversible terminator
chemistry)测序技术使之成为新一代测序技术中应用最为广泛的技术平台。
对于细菌、真菌等基因组测序,Solexa高通量测序技术和
Solexa Paired-End技术使得基因组测序成本及基因组组装难度均大大降低,缩短了测序时间,用传统测序法1/5的费用和1/3的时间即可得到更
高精度和覆盖倍数的基因组精细图,生物信息学分析也更加完善。
技术路线:

样品要求:
⑴样品纯度要求: OD值应在1.8至
2.0之间;电泳检测无明显RNA条带,基因组条带清晰、完整。
⑵样品浓度:浓度不低于200ng/ul;样品总量不低于10ug。
⑶请提供
DNA样品具体浓度、体积、制备时间、溶剂名称及物种来源。请同时附上QC数据,包括电泳胶图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。如需进行
多次样品制备,需要提供多次样品制备所需样品。



全基因组重测序

基因组的重测序可以辅助研究者发现单核苷酸多态性位点(SNPs)
、拷贝数变异(Copy Number Variation, CNV)、插入(Insertion)、缺失(Deletion)等变异类型,以最廉价的方式将单个参考基因组信息
扩增为生物群体的遗传特征。这在人类疾病及动植物育种研究等方面具有重大的指导意义。 GAⅡx新增的长插入片段(2-5kb)试剂与已有的双
末端(Paired-end)短插入片段相结合,使得深入分析参考系列以外的基因组插入和结构变异成为可能。
技术路线:

样品要求:
⑴客户需
要提供可以证明所提供DNA完整性和准确浓度的包括DNA检测的胶图, 紫外分光光度计(nanodrop)检测结果,或者Aglient 2100 Bio-Analyzer
的检测结果中一种或多种形式的样品分析结果;
⑵样品纯度:OD值应在1.8~2.0 之间;
⑶样品浓度:样品的浓度越高越好,最低不应低于
30ng/μl;样品的量:每次样品制备需要10ug样品;
⑷ DNA如果用乙醇沉淀,则可以常温运输;否则用干冰运输,时间不要超过72小时;如果
利用冰袋运输,时间不要超过24小时;且在运输过程中务必将管口密封好。


宏基因组测序
宏基因组即生境中全部微小生物遗传物质的
总和。它以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象, 以功能基因筛选和测序分析为研究手段, 以微生物多样性、种群结构、进化关系、功
能活性、相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的。宏基因组学技术第一次使人类得以研究占环境中99%的不可培养的微生物种群,从而成
为微生物研究的最前沿领域。
 

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